ウィンドウは最小化して Dockに格納することもできますが、より便利な方法がExposeです。 このExpose機能を利用することで、見にくさを解消出来ます。 例えば、開いているすべてのウィンドウを一度に表示でき、 ウィンドウをクリックすれば、簡単に手前に移動することができます。
Appleサポートの Exposeも参照してください。